В 2007 году школа приняла участие в конкурсном отборе инновационных общеобразовательных учреждений и набрала 83,2 балла из 100 возможных.
В рамках одного из направлений приоритетного национального проекта «Образование» (обеспечение доступности качественного образования) в школе проводятся научные конференции учащихся, олимпиады, конкурсы, что позволяет выявить способных учащихся для участия в городских и областных научных конференциях и олимпиадах. Ежегодно наши обучающиеся занимают призовые места в городских научно—практических конференциях, принимают участие в межвузовских конференциях. На базе школы ежегодно проводится городская интеллектуальная олимпиада учащихся развивающего обучения. В 2006-2007 учебном году команда нашей школы заняла 1 место.
МОУ «СОШ с УИОП №29» с 2000 года принимает участие в опытно – экспериментальной работе по разработке модели подростковой школы в рамках образовательной системы Д.Б. Эльконина - В.В. Давыдова, которая была начата Международной ассоциацией развивающего обучения и Открытым институтом «Развивающее образование» (г. Москва) по поручению МО РФ. На базе ОИРО была организована сетевая экспериментальная площадка, в которую вошли 76 школ РФ. В 2004 году ОИРО стал официальной Федеральной экспериментальной площадкой МО и НРФ. Научный руководитель сети - вице-президент МАРО, доктор психологических наук, профессор Б.Д. Эльконин. На базе сетевой экспериментальной площадки ведется разработка и апробация новых учебных курсов по алгебре (авт. Горбов С. Ф., к.п.н., Заславский В. М., к.п.н.), биологии (авт. Чудинова Е. В., к.п.н.), географии (авт. Воронцов А. Б., к.п.н), физике (авт. Львовский В. А., к.п.н.), химии (авт. Высоцкая Е.В., к.п.н ), форм и методов обучения учащихся 5-9 классов. В МОУ СОШ с УИОП №29 апробирована и успешно функционирует модель подростковой школы, которая позволяет формировать самостоятельность подростка, способного на заключительном этапе школьного образования построить собственную образовательную программу и выполнить ее. Выпускники подростковой школы 2004 года продолжили обучение в социально- гуманитарном профильном классе. В 2006 учебном году из 22 выпускников экспериментального класса в вузы поступили 21 человек.
С 2004 года в школе введено профильное обучение, что позволяет расширить возможности социализации учащихся, обеспечить преемственность между общим профессиональным образованием и эффективнее готовить выпускников школы к освоению программ высшего профессионального образования. В 2005—2006 учебном году 95% обучающихся профильной школы поступили в высшие образовательные учреждения, из них 76% - на бюджетные места. Новый статус школы с углубленным изучением отдельных предметов, ее высококвалифицированный педагогический коллектив, постоянно пополняющаяся материально—техническая база позволяет давать достойное, качественное бесплатное образование детям. Всестороннему развитию наших обучающихся способствует широкий спектр бесплатных образовательных услуг, работа блока эстетического развития, тесное содружество со школой искусств №1.
Одним из важных направлений воспитательной работы школы является воспитание всесторонне развитой личности, военно-патриотическое воспитание, формирование санитарно-гигиенических навыков, пропаганда здорового образа жизни, вовлечение учащихся в спортивно-массовые мероприятия. В 2006 году прошла торжественная закладка аллеи первоклассников, в которой приняли участие ученики 1-х и 11-х классов. Учащиеся нашей школы принимают активное участие в городских и областных мероприятиях. В рамках акции «За здоровый образ жизни» представители школьной думы приняли участие в волонтерском движении «Зажги надежду», в факельном шествии «Скажи нет!», посвященном Всемирному дню борьбы со СПИДом. Традиционным стало посвящение первоклассников в школьники, проведение праздника первого звонка, праздника, посвященного Дню Победы.
Совместно с молодежной палатой при областной Думе учащиеся 10-11 классов приняли участие в брифинге «Молодежь против наркотиков», организованном на базе наркологического диспансера. В этом учебном году ребята нашей школы приняли участие в городских соревнованиях «Магаданские витязи» и заняли почетные II и III места. Особое внимание уделяется коллективно-творческим делам. Внеклассное занятие «Формула здоровья», выпуск газеты «А ты, здоров?», игра по станциям «Откуда берутся грязнули», «Найди клад» для учащихся начального и среднего звена. Для 10-11 классов проводятся мероприятия «А ну-ка, парни!», «А ну-ка, девушки!». Традиционными являются такие мероприятия, как день учителя, новогодний калейдоскоп, последний звонок.
Одним из подразделений школы является «Социум»
