К началу 2017 года в ведомственном реестре Межрегионального Управления Министерства юстиции значится 54 религиозных организаций (44 - в Магаданской области и 10 на Чукотке).
Состав религиозных организаций в Магаданской области определяется следующим образом: Русская Православная церковь - 26, христиане веры евангельской - пятидесятники - 3, христиане веры евангельской - 5, евангельских христиан-баптистов - 3, римско-католическая - 1, исламская - 1, адвентисты седьмого дня - 1, иудаизм (ортодоксальный) - 1, Церковь Иисуса Христа Святых последних дней - 1, евангелическо-лютеранская церковь - 1, иные - 1. В Чукотском автономном округе из 10 религиозных организаций: 5 - Русской Православной церкви, 3 - христиан веры евангельской, 1 - христиан веры евангельской - пятидесятников, 1 - евангельских христиан.
В соответствии с сообщениями судов решения о признании материалов экстремистскими, ликвидации или запрете деятельности религиозных организаций по основаниям, предусмотренным Федеральным законом «О противодействии экстремистской деятельности», не принимались.
