Сотрудниками института накоплен уникальный опыт регионального изучения геологии Северо-Востока России, акватории Мирового океана, месторождений золота, серебра, платины, олова, стратиформных полиметаллических руд, проведения археологических работ и социально-экономических исследований на Крайнем Севере.
СВКНИИ поддерживает постоянные связи с учеными из многих городов России, а также из Европы, США, Канады, Австралии, Китая, Японии. В 1996 – 2005 гг. в институте выполнялись международные исследования по 6 долгосрочным международным проектам.
Результаты проводимых в институте исследований регулярно докладываются на всероссийских и международных научных форумах. Институт неоднократно выступал в качестве организатора региональных, российских и международных совещаний, симпозиумов, конгрессов; принимал участие в организации и проведении экскурсий по территории Северо-Востока России по программам XIV Конгресса Тихоокеанской научной ассоциации (1979 г), XXVI Международного геологического конгресса (1984 г), Международной конференции по арктическим окраинам (1992 г., 1994 г.), Международного симпозиума «Тектоника, геодинамика и металлогения Севера Пацифики» (2004 г.).
Указом от 29 мая 1981 г. Президиум Верховного СССР за заслуги в развитии науки и подготовки научных кадров наградил Северо-Восточный комплексный научно-исследовательский институт Дальневосточного научного центра Академии наук СССР орденом «Знак Почета». Большая группа сотрудников института также была удостоена орденов и медалей.
Учёные института В.Ф. Белый, Р.А. Ерёмин, Н.Е. Савва, А.А. Сидоров, К.В. Симаков, В.И. Гончаров за свои труды удостоены различных премий Академии наук СССР.
С момента организации СВКНИИ получил право самостоятельного издания научных трудов. К настоящему времени результаты исследований сотрудников института опубликованы более чем в 240 монографиях, в нескольких тысячах статей, сведены в сотни научных отчётов.
За время существования института 57 его сотрудников защитили докторские и более 200 — кандидатские диссертации.
Ученые института являются членами экспертного совета по инновационным проектам при губернаторе области.
В высших учебных заведениях города преподают 23 сотрудника института, ими постоянно ведется работа по привлечению наиболее способных студентов в процесс научных исследований.
С 2002 года институт регулярно проводит прием в аспирантуру.
В 2012 году Институту присвоено имя академика Николая Алексеевича Шило.
В соответствии с Федеральным законом от 27 сентября 2013 г. № 253-ФЗ «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» и распоряжением Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2013 г. № 2591-р Институт передан в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО России).
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 30.05.2018 № 1055-р организации, ранее находившиеся в ведении упраздняемого ФАНО России, отнесены к ведению Министерства науки и высшего образования Российской Федерации.
На 1 января 2020 года в СВКНИИ ДВО РАН работали 158 человек, из них 2 члена-корреспондента РАН, 10 докторов наук, 25 кандидата наук, всего научных сотрудников — 56 человек.
