Отдел НКВД по Дальстрою (на правах оперативного сектора НКВД СССР) подчинялся уполномоченному НКВД СССР Э. П. Берзину и начальнику УНКВД по ДВК, а в части обслуживания ИТЛ — начальнику Севвостлага. Начальником Отдела НКВД по Дальстрою назначен Куцерубов Павел Николаевич.
Новой структуре вменялись функции по борьбе с контрреволюцией во всех её проявлениях, должностными и уголовными преступлениями.