В его состав вошли прииски «Партизан», имени Водопьянова, «Штурмовой», «Верхний Ат-Урях», «Нижний Ат-Урях», «Бурхала». В 1957 г. предприятие стало называться Ягоднинским районным горнопромышленным управлением. В 1967 г. на его основе образовались Оротуканский и Ягоднинский ГОКи. 9 июня 1994 г. зарегистрировано АООТ «Ягоднинский ГОК», а спустя десять лет - в мае 2004 г. - решением Арбитражного суда Магаданской области комбинат объявлен несостоятельным (банкротом).
