МАГАДАН. КОЛЫМА-ИНФОРМ. Приказ о наделении Магаданского филиала Тихоокеанского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии (Владивосток) статусом самостоятельного федерального научного учреждения был подписан 29 июня 2001 г.
После реорганизации и регистрации в новом качестве научное учреждение было открыто в новом помещении.
С этого момента МагаданНИРО самостоятельно определяет направления научно-исследовательских работ, работает исключительно на потребности рыбной отрасли территории: отслеживает популяции полусотни даров моря от бурых водорослей до лосося, ищет новые места для промысла рыбаков в морских и прибрежных экспедициях, разводит лосось в колымских реках, ратует за возрождение зверобойного промысла.